Class Hierarchy
- java.lang.Object
- picard.sam.util.Pair<X,Y> (implements java.lang.Comparable<T>)
- picard.sam.util.PGTagArgumentCollection
- picard.sam.util.PhysicalLocationInt (implements picard.sam.util.PhysicalLocation)
- picard.sam.util.PhysicalLocationShort
- picard.sam.util.PrimaryAlignmentKey (implements java.lang.Comparable<T>)
- picard.sam.util.ReadNameParser (implements java.io.Serializable)
- picard.sam.util.RepresentativeReadIndexer
- picard.sam.util.SamComparison
- picard.sam.util.SAMComparisonArgumentCollection
Interface Hierarchy
- java.io.Serializable
- picard.sam.util.PhysicalLocation
Enum Hierarchy
- java.lang.Object
- java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)
- picard.sam.util.SamComparison.AlignmentComparison
- java.lang.Enum<E> (implements java.lang.Comparable<T>, java.io.Serializable)